その流れで言えば

当然のことだと思います。
「防衛「省」昇格関連法案を閣議決定」
http://www.sankei.co.jp/news/060609/sei047.htm

政府は９日午前、防衛庁の「省」昇格関連法案を閣議決定した。同日中に国会に提出するが、今国会では継続審議となり、成立は秋に予定される臨時国会以降に先送りされる。
法案では、内閣府の外局と位置づけられている防衛庁を独立した「防衛省」に変更。海上警備行動などを発令する際、内閣府を通さずに閣議の開催を要求できるようになるなど、事務手続きが簡素化されることで迅速な対応が可能になる。